John Travolta, Kirstie Alley, Lisa Marie Presley, Tom Cruise, são alguns dos muitos seguidores famosos, contudo um destes famosos deixou a Cientologia acusando-a de homofóbica.
O cineasta Paul Haggis, deixou a Cientologia por esta ter posições homofóbicas. O fundador da Igreja já havia proferido declarações homofóbicas, apontando as pessoas homossexuais como de pervertidos e "extremamente perigosos para a sociedade".
Haggis disse na sua carta que a recusa da Igreja em denunciar acções homofóbicas de alguns fanáticos, é um acto cobarde, Eu posso pensar diferente e dizer, mas o silêncio é consentimento", disse Paul Haggis. Na missiva dirigida á Igreja e saltou para a comunicação social, Haggis faz um ataque claro por esta ter apoiado a Proposta 8, que proibiu o casamento entre pessoas do mesmo sexo na Califórnia, dizendo mesmo que a Igreja nada fez para deter os homofóbicos.
Contudo alguns dos seguidores dizem que as posições denunciadas por Haggis estão a mudar.